180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0360 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  52.92 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  54.11 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  54.11 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  48.97 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  45.45 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 125 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  36.28 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  36.79 
 
 		 115 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  35.19 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  31.25 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  34.21 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.65 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  35.96 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  34.58 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  35.96 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  33.64 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.79 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 118 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  29.41 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  29.55 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  28.7 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  29.55 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  31.48 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  32.73 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  31.63 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  35.29 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  30.77 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  30.77 
 
 		 114 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  30 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  31.78 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 116 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  28.75 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  32.08 
 
 		 114 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  24.75 
 
 		 114 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  26.09 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  28.16 
 
 		 111 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  30.48 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  34.29 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  31.65 
 
 		 112 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 141 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 129 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  47.5 
 
 		 125 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  28.12 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  31.96 
 
 		 118 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.08 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  30.11 
 
 		 111 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 117 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  32.63 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  27.37 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  28.04 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2469  putative transcriptional regulator, ModE family  33.78 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  30.84 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>