More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0071 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  93.92 
 
 
181 aa  344  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  93.92 
 
 
181 aa  344  4e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  93.37 
 
 
181 aa  344  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  85.64 
 
 
181 aa  318  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  85.08 
 
 
181 aa  317  4e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  83.33 
 
 
180 aa  311  3e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  82.87 
 
 
181 aa  310  6e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  76.24 
 
 
181 aa  292  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 
181 aa  237  6e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  217  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.21875e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  216  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  216  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.05231e-10  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.67515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.10602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.4971e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.42561e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  215  3e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  214  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  9.73841e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  214  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.41034e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  213  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 
179 aa  213  1e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 
179 aa  212  3e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.51494e-08  hitchhiker  2.15768e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  211  4e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
184 aa  211  6e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.09145e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
180 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.891e-13  hitchhiker  1.42331e-08 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  52.78 
 
 
182 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 
179 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.59394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  208  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  9.18773e-05  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  51.69 
 
 
198 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  53.11 
 
 
179 aa  207  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 
186 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  207  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  207  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.6872e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 
220 aa  206  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 
179 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  5.14338e-08 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
180 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
193 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  205  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  53.67 
 
 
184 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
180 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  205  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.28696e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  205  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  4.92925e-07  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
182 aa  205  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 
186 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 
186 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 
180 aa  204  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  204  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.57124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  204  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  3.34346e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  204  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
180 aa  204  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.53341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.91784e-05  decreased coverage  1.59528e-12 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  204  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
179 aa  203  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
179 aa  203  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
187 aa  203  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  52.27 
 
 
180 aa  203  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.36649e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
180 aa  203  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.63356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67314e-10 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 
180 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.1863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.38083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 
180 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 
180 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 
179 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
186 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 
185 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
180 aa  202  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 
179 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 
180 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  5.00711e-07  hitchhiker  2.37864e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.58896e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 
180 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  3.12511e-06  hitchhiker  9.22003e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 
180 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.19375e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  53.93 
 
 
179 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 
192 aa  201  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.31998e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  53.11 
 
 
179 aa  201  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
179 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
184 aa  201  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
193 aa  201  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.40969e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>