More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1074 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.66 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.63 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  35.47 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  35.47 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  31.62 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.62 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.62 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  35.47 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  31.62 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.62 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  34.98 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  35.47 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.2 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.92 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  27.92 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.77 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>