More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3954 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  969    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.47 
 
 
493 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.26 
 
 
496 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.02 
 
 
493 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
493 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.64 
 
 
489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 
492 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.27 
 
 
489 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
486 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  63.85 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
488 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
484 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
486 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
486 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.64 
 
 
483 aa  594  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  61.84 
 
 
491 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
509 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.52 
 
 
495 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.13 
 
 
486 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.59 
 
 
485 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
485 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 
483 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  61.81 
 
 
482 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
493 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.8 
 
 
479 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
503 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
489 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.89 
 
 
484 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
503 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.84 
 
 
479 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.34 
 
 
489 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.05 
 
 
479 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 
486 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.64 
 
 
484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.59 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59 
 
 
483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59 
 
 
483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.34 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.79 
 
 
483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
479 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.53 
 
 
490 aa  581  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.19 
 
 
482 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.19 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.98 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.72 
 
 
491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.79 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 
492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.77 
 
 
482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.49 
 
 
482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 
500 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  57.35 
 
 
482 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.95 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.07 
 
 
492 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.35 
 
 
482 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.53 
 
 
482 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3863  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
485 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.19 
 
 
480 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
488 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.53 
 
 
482 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.53 
 
 
482 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  57.35 
 
 
482 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.14 
 
 
482 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.95 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.07 
 
 
482 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.74 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.38 
 
 
496 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2023  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
490 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.491893  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.21 
 
 
492 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.44 
 
 
482 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.65 
 
 
482 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  60.47 
 
 
480 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.32 
 
 
482 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.95 
 
 
480 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32220  Succinate-semildehyde dehydrogenase  64.21 
 
 
484 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.17 
 
 
496 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.59 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.38 
 
 
500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.33 
 
 
487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3342  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 
492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.420157  normal  0.140471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.65 
 
 
490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>