More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0677 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
260 aa  494  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
278 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
269 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
277 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 
276 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
277 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
277 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 
280 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 
268 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
281 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 
274 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
272 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
301 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
273 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.21 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.21 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.48 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
273 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
276 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
300 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
282 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
274 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.29 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
271 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
272 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
272 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
267 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
273 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.32 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
289 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.38 
 
 
286 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
271 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.39 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
274 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.32 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
270 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.94 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
273 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
284 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
272 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
274 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
272 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
264 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.91 
 
 
270 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
271 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 
257 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
263 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
277 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  33.95 
 
 
283 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
274 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
271 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>