More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0388 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 354 aa  704    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.27 
 
 		 343 aa  360  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.82 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.8 
 
 		 348 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.59 
 
 		 367 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.23 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.45 
 
 		 364 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.45 
 
 		 364 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.91 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.47 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.18 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.89 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.3 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.62 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 362 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.59 
 
 		 364 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.41 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.56 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.3 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.57 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.42 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  51.87 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  51.72 
 
 		 374 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.6 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.08 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.31 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.42 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  48.75 
 
 		 384 aa  298  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.35 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.85 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.85 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.3 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.56 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 361 aa  278  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  45.64 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.75 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.35 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.04 
 
 		 357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.54 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.34 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.31 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.05 
 
 		 350 aa  270  4e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 		 351 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  42.4 
 
 		 456 aa  268  8e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.59 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.05 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.32 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  43.24 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.68 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  42.52 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.82 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.83 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.48 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  43.33 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.27 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.7 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.83 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  43.54 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.12 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.32 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  42.27 
 
 		 348 aa  253  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 360 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.17 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.03 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.86 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  45.51 
 
 		 363 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  45.51 
 
 		 363 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>