More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3018 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  80 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  77.43 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  69.51 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  65.71 
 
 		 226 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 218 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 211 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 217 aa  265  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 226 aa  265  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  58.14 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  55.98 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  57.67 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  52.52 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 211 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 222 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 210 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  57.89 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  57.21 
 
 		 224 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 218 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  56.42 
 
 		 278 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 217 aa  257  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  50 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 210 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 210 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  49.39 
 
 		 288 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 211 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  52.44 
 
 		 272 aa  253  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  49.39 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  49.37 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  51.29 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  55.98 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  52.91 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  52.99 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  51.08 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  52.16 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 243 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  51.74 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  52.94 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 325 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  52.83 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  51.72 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  51.74 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  52.83 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  52.09 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  52.19 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  51.49 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  51.49 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>