More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3005 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  69.72 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  64.12 
 
 
174 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  64.81 
 
 
174 aa  174  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 
147 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.63 
 
 
153 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 
146 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 
146 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  140  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 
153 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 
146 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 
146 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 
146 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 
147 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 
147 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.68 
 
 
153 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  55.24 
 
 
147 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
146 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  55.17 
 
 
148 aa  134  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  52.78 
 
 
146 aa  134  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  54.48 
 
 
147 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 
146 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  53.15 
 
 
153 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
148 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  49.65 
 
 
176 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  54.97 
 
 
153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  54.11 
 
 
152 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  52.78 
 
 
146 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 
161 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  51.75 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  49.03 
 
 
163 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 
147 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
151 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 
154 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  53.79 
 
 
147 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  48.61 
 
 
149 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 
147 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
149 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
149 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
149 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  51.41 
 
 
147 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  50.68 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  52.08 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 
147 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  53.47 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  48.34 
 
 
150 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  47.65 
 
 
154 aa  117  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  51.41 
 
 
146 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  50.35 
 
 
162 aa  117  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  51.03 
 
 
151 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  46.9 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.95 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  51.75 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  47.44 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  49.65 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.15 
 
 
149 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  47.33 
 
 
152 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 
150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  47.02 
 
 
146 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
148 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  48.05 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  49.65 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  114  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
149 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  47.59 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  42.25 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  42.25 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  48.63 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>