More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0016 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  452  1e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.07 
 
 
237 aa  266  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.05 
 
 
232 aa  265  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
233 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
261 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
244 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
241 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
240 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
244 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
233 aa  140  1e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
235 aa  139  4e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
241 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
261 aa  132  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
244 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
238 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
242 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
242 aa  130  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 
254 aa  130  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1866  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
240 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05911  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
240 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
239 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 
235 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
241 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0731  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
235 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
243 aa  117  1e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.54 
 
 
236 aa  117  2e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
239 aa  116  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  37 
 
 
245 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
242 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.7 
 
 
248 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
246 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  114  9e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
248 aa  114  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  39.04 
 
 
301 aa  114  1e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
247 aa  114  1e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
238 aa  114  2e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0693  sepiapterin reductase  32.2 
 
 
241 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
255 aa  112  4e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
264 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
233 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.23483e-07  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
259 aa  111  8e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
251 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
249 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
339 aa  111  1e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
249 aa  110  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
249 aa  110  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
249 aa  110  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
239 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
239 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
239 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
239 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
242 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
242 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
242 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
242 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
242 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
249 aa  109  4e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
239 aa  109  4e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
231 aa  109  4e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.08 
 
 
260 aa  109  4e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
239 aa  109  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
231 aa  109  4e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
257 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
236 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
236 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
251 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.5 
 
 
244 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.44 
 
 
238 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
243 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
271 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169206  normal  0.0484523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
271 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
244 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
249 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 
246 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
246 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
270 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
259 aa  105  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
254 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
261 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
241 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
248 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
223 aa  104  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.2 
 
 
260 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
240 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
243 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
241 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.72 
 
 
241 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
264 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
299 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 
234 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
244 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  9.89308e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
274 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
255 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31904e-06  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.68 
 
 
235 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
234 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
239 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
327 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
260 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>