More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0885 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  53.95 
 
 		 218 aa  225  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  50 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  49.07 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  44.39 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  41.86 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  41.71 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  39.3 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  37.02 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  32.66 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  31.6 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.62 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.28 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.97 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  27.72 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  28.26 
 
 		 265 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  27.36 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  29.41 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  37.04 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.92 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.23 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.14 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  27.27 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  26.44 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.75 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.75 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  28.8 
 
 		 293 aa  62  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.63 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.63 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.58 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  22.28 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  23.78 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  22.28 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  25.62 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.86 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.78 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.71 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.78 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.39 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  31.93 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>