More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8431 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 133 aa  265  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  60.47 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  55.93 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  58.62 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  50.46 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  43.36 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  45.79 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  42.48 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  43.97 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.72 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  48.53 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40.52 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  40.2 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.38 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.06 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  54 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.29 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  31.85 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 345 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.89 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  31.4 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  44.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>