More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5424 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  89.55 
 
 
139 aa  248  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.93 
 
 
139 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.09 
 
 
138 aa  202  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 
139 aa  202  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  68.94 
 
 
215 aa  196  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  69.7 
 
 
147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.44 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  70.31 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  72 
 
 
135 aa  194  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.32 
 
 
136 aa  194  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  65.91 
 
 
141 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  69.53 
 
 
453 aa  190  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  70.31 
 
 
140 aa  190  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  65.91 
 
 
141 aa  190  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.19 
 
 
135 aa  189  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  68.22 
 
 
136 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.87 
 
 
136 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.42 
 
 
143 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.75 
 
 
150 aa  188  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  68.22 
 
 
136 aa  188  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.4 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  66.92 
 
 
148 aa  184  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  70.73 
 
 
138 aa  183  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  62.6 
 
 
217 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  62.6 
 
 
217 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  62.6 
 
 
217 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  64.34 
 
 
225 aa  180  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  62.5 
 
 
223 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  64.34 
 
 
225 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  63.16 
 
 
498 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 
222 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  62.31 
 
 
294 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  57.58 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.84 
 
 
227 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.69 
 
 
227 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  54.33 
 
 
144 aa  153  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.69 
 
 
219 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.73 
 
 
408 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  52.34 
 
 
337 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.18 
 
 
130 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.12 
 
 
347 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  50.39 
 
 
337 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 
137 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.39 
 
 
229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  51.54 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  49.59 
 
 
336 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 
349 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  49.22 
 
 
135 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.61 
 
 
147 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 
132 aa  120  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  45.32 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  45.16 
 
 
125 aa  105  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.18 
 
 
140 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
133 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.22 
 
 
143 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
133 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.34 
 
 
143 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 
148 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 
144 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
137 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  43.2 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  40 
 
 
138 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  37.14 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  40.58 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  38.93 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
145 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
145 aa  94  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  39.39 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  37.8 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  37.8 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.32 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  34.4 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.43 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  36.17 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.06 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  39.06 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.76 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
299 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.55 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>