More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5001 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 365 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.53 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 371 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.26 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.27 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 405 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  31.02 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.58 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  30.07 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 750 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  30.28 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 377 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  29.37 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.05 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  33.88 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.66 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  27.97 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  29.37 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.4 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 739 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.41 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>