More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1490 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1488  flagellin  93.8 
 
 
517 aa  874    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  100 
 
 
516 aa  978    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
484 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  48.85 
 
 
467 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  48.94 
 
 
485 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  48.18 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  47.42 
 
 
492 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  46.77 
 
 
488 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.39 
 
 
492 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 
482 aa  356  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  47.36 
 
 
481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  45.09 
 
 
483 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  44.42 
 
 
475 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  44.05 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  42.18 
 
 
493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  41.25 
 
 
494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  41.48 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  41.19 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  40.42 
 
 
506 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  41.38 
 
 
471 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  38.02 
 
 
492 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  41.46 
 
 
472 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  57.88 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  40.34 
 
 
486 aa  262  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  68.5 
 
 
394 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  39.88 
 
 
488 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  38.88 
 
 
405 aa  246  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  37.34 
 
 
506 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  37.34 
 
 
506 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  37.33 
 
 
498 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  36.97 
 
 
506 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  36.43 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  36.38 
 
 
493 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  36.02 
 
 
493 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  36.7 
 
 
502 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  36.49 
 
 
505 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  68.07 
 
 
687 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  70.89 
 
 
387 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  35.41 
 
 
545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  60 
 
 
375 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  59.89 
 
 
377 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  58.67 
 
 
402 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  63.69 
 
 
379 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  32.96 
 
 
502 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  66.27 
 
 
379 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  53.21 
 
 
377 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  53.21 
 
 
377 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  60.11 
 
 
377 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  65.64 
 
 
377 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  59.55 
 
 
376 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  66.26 
 
 
377 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  66.26 
 
 
377 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  35.73 
 
 
498 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  60.11 
 
 
376 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  51.72 
 
 
377 aa  207  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  51.71 
 
 
378 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  59.34 
 
 
377 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  65.64 
 
 
294 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  67.52 
 
 
490 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  53.22 
 
 
376 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  34.36 
 
 
420 aa  203  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  62.5 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  42.47 
 
 
609 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 
294 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  53.61 
 
 
385 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  56.84 
 
 
271 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  56.84 
 
 
271 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  62.11 
 
 
378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.59 
 
 
276 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  65 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  45.24 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  61.31 
 
 
384 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  55.5 
 
 
272 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  55.5 
 
 
272 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  56.98 
 
 
270 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  63.98 
 
 
319 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 
271 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 
271 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  58.15 
 
 
282 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  57.56 
 
 
271 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  57.56 
 
 
271 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  59.52 
 
 
404 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  58.02 
 
 
580 aa  190  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  58.24 
 
 
404 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  30.35 
 
 
519 aa  188  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
492 aa  189  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  31.9 
 
 
518 aa  186  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  60.25 
 
 
587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  56.5 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  62.96 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  57.47 
 
 
271 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  56.55 
 
 
275 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  55.37 
 
 
274 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  55.95 
 
 
275 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 
273 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 
273 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  61.49 
 
 
319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  56.89 
 
 
273 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  58.08 
 
 
272 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  48.46 
 
 
282 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>