More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1181 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  96.52 
 
 		 402 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  100 
 
 		 402 aa  809    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  54.14 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  51.94 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  48.99 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  45.71 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  43.89 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  46.85 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  42.43 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  46.85 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  46.85 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.42 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  45.14 
 
 		 421 aa  336  5e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  44.61 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  46.48 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  46.48 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.68 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  46.63 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.1 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  42.68 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  41 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  42.03 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  39 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  44.5 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  38.87 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.64 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  41.1 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  44.17 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.83 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  41.96 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  43.32 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  38.64 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  43.59 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 412 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 443 aa  288  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  43.92 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.75 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 404 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  42.24 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  45.01 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  45.73 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  42.07 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.3 
 
 		 416 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.73 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  39.09 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  41.55 
 
 		 514 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  36.02 
 
 		 526 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  41.13 
 
 		 503 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  37.37 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  37.09 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.75 
 
 		 507 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  43.2 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  40.31 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  39.25 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  37.78 
 
 		 513 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  37.59 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  33.92 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  42.35 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  36.95 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.85 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  39.28 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  37.88 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  35.77 
 
 		 531 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  44.72 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  44.72 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  36.32 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  38.35 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.31 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  38.58 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>