More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0025 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  40.57 
 
 
1241 aa  915  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  37.4 
 
 
1377 aa  796  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  40.94 
 
 
1244 aa  955  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  47.27 
 
 
1248 aa  1108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.33 
 
 
1241 aa  911  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  39.86 
 
 
1242 aa  872  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.25 
 
 
1241 aa  912  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  100 
 
 
1270 aa  2567  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  40.57 
 
 
1242 aa  927  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.49 
 
 
1241 aa  914  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  40.06 
 
 
1241 aa  911  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  38.39 
 
 
1230 aa  826  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  46.68 
 
 
1251 aa  1130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  48.9 
 
 
1233 aa  1134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  34.09 
 
 
1282 aa  685  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  41.35 
 
 
1236 aa  877  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.02 
 
 
1241 aa  907  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.27 
 
 
1271 aa  2477  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  40.57 
 
 
1241 aa  915  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.17 
 
 
1241 aa  910  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  34.16 
 
 
1217 aa  648  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  40.26 
 
 
1405 aa  722  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.57 
 
 
1240 aa  918  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  34.18 
 
 
1392 aa  747  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.49 
 
 
1241 aa  911  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  34.16 
 
 
1217 aa  648  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  40.77 
 
 
1244 aa  876  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  33.2 
 
 
1218 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.18 
 
 
1230 aa  522  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  30.19 
 
 
1204 aa  508  1e-142  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  31.05 
 
 
1392 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.88 
 
 
1186 aa  461  1e-128  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 
1240 aa  442  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 
1121 aa  428  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.11 
 
 
1203 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.05 
 
 
1217 aa  419  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  26.88 
 
 
1207 aa  402  1e-110  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.04 
 
 
1226 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.84 
 
 
1057 aa  201  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 
1184 aa  199  2e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  21.22 
 
 
1123 aa  181  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 
1165 aa  164  8e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  23.09 
 
 
1061 aa  162  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 
1173 aa  159  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  22.19 
 
 
1173 aa  150  2e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  22.47 
 
 
1173 aa  150  2e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.31 
 
 
1089 aa  149  5e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  22.01 
 
 
1177 aa  147  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  21.79 
 
 
1110 aa  146  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 
1080 aa  144  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 
1185 aa  144  1e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  22.9 
 
 
1121 aa  141  8e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 
1120 aa  141  9e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.73 
 
 
1177 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 
1130 aa  140  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  23.77 
 
 
854 aa  137  1e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  21.2 
 
 
1161 aa  136  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.82 
 
 
1197 aa  132  5e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 
1147 aa  130  2e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  23.58 
 
 
1124 aa  129  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.85 
 
 
860 aa  129  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.4 
 
 
1183 aa  128  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  21.74 
 
 
1262 aa  128  8e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  22.15 
 
 
1164 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 
1115 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  22.79 
 
 
1161 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.6 
 
 
1089 aa  124  2e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 
1196 aa  120  1e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 
1149 aa  120  1e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 
1161 aa  119  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.29 
 
 
1226 aa  118  7e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  23.68 
 
 
833 aa  117  1e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  23.01 
 
 
1187 aa  117  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 
1065 aa  116  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.08 
 
 
1139 aa  114  1e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.86 
 
 
776 aa  114  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 
1074 aa  114  1e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.68 
 
 
772 aa  114  1e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  24.06 
 
 
1180 aa  114  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.35 
 
 
763 aa  112  4e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  22.23 
 
 
1134 aa  112  4e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  22.73 
 
 
1095 aa  112  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  24.53 
 
 
1164 aa  112  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  20.36 
 
 
1147 aa  112  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  23.88 
 
 
1110 aa  112  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.47 
 
 
1209 aa  111  7e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.3 
 
 
1229 aa  111  8e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 
1117 aa  111  9e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  22.89 
 
 
1180 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 
1003 aa  110  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  21.55 
 
 
1125 aa  109  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  22.72 
 
 
1290 aa  109  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  22.74 
 
 
1180 aa  109  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  23.93 
 
 
1151 aa  108  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  22.15 
 
 
1185 aa  105  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 
1165 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  22.51 
 
 
1131 aa  105  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  23.83 
 
 
1156 aa  105  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  23.16 
 
 
1183 aa  104  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 
1052 aa  104  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>