54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3233 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1087 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  100 
 
 		 1048 aa  2140    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  38.79 
 
 		 1072 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.63 
 
 		 1078 aa  288  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0419  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1129 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  25.27 
 
 		 982 aa  139  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.42 
 
 		 1028 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  24.55 
 
 		 1060 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1041 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.28 
 
 		 970 aa  66.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1041 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.73 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  28.24 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1012 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  20.61 
 
 		 956 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  20.94 
 
 		 440 aa  53.5  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.43 
 
 		 1071 aa  53.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  22.09 
 
 		 440 aa  52  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  23.56 
 
 		 572 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  24.42 
 
 		 437 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  24.42 
 
 		 440 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  23.84 
 
 		 567 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  37.5 
 
 		 615 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 431 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 431 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 431 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  24.17 
 
 		 426 aa  48.9  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 441 aa  48.9  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.55 
 
 		 430 aa  48.9  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 431 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.55 
 
 		 436 aa  47.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 431 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 		 186 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  25.86 
 
 		 1042 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.31 
 
 		 435 aa  47  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  27.27 
 
 		 728 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  25.25 
 
 		 463 aa  46.2  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  20 
 
 		 1021 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 433 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 463 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 433 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 431 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  22.77 
 
 		 1077 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  21.97 
 
 		 450 aa  45.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  23.66 
 
 		 1078 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  28.68 
 
 		 190 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.68 
 
 		 190 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30 
 
 		 1167 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 463 aa  45.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 430 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 430 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.84 
 
 		 1066 aa  44.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.35 
 
 		 444 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>