More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2754 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  71.3 
 
 		 440 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  75.93 
 
 		 439 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 443 aa  890    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  69.54 
 
 		 450 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  69.95 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  67.89 
 
 		 441 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  68.59 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  67.49 
 
 		 445 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  70.67 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  65.65 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  60.31 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.28 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  58.78 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  57.47 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  55.78 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  57.63 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  55.88 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  56 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.9 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  54.72 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.46 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  54.02 
 
 		 452 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.31 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  54.42 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.92 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.99 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.01 
 
 		 463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.6 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  54.07 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.01 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.85 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.75 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  52.58 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  52.58 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.98 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.5 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  52.58 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53.79 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  52.38 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  52.38 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.14 
 
 		 446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  52.39 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.91 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.32 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.96 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.43 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.94 
 
 		 481 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  48.99 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  52.8 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.29 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 433 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  49.42 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.64 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  50.36 
 
 		 519 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.55 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.95 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  47.74 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  48.33 
 
 		 522 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.86 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  50.93 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  50.11 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.17 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  48.1 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  46.83 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  48.55 
 
 		 528 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  48.26 
 
 		 524 aa  428  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  48.96 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  47.32 
 
 		 447 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.29 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 515 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>