213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1274 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
245 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  40.33 
 
 
281 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  41.08 
 
 
237 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  36.89 
 
 
267 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  36.93 
 
 
254 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  36.93 
 
 
266 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  36.73 
 
 
266 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  37.24 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  36.51 
 
 
317 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 
505 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
437 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  30.9 
 
 
321 aa  99.4  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 
443 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 
439 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 
443 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  25.3 
 
 
447 aa  86.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 
439 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.56 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  31.69 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  26.59 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  29.95 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.47 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  28.74 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  27.36 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  26.72 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43288  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  29.96 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.07 
 
 
298 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  24.32 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.59 
 
 
307 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
383 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
379 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.82 
 
 
384 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
383 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.33 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 
379 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 
374 aa  59.3  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 
383 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.19 
 
 
379 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1424  Prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 
383 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
284 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  26.1 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  30.23 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.41 
 
 
313 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  32.54 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  27.13 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.62 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.83 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.47 
 
 
384 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  25.58 
 
 
287 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 
379 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  26.2 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.34 
 
 
313 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.31 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 
372 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 
384 aa  55.8  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 
384 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.09 
 
 
314 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  25.12 
 
 
364 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  23.04 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.74 
 
 
379 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.09 
 
 
379 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>