More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1498 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  57.14 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 		 270 aa  274  9e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  55.25 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 276 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 276 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  39.49 
 
 		 510 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.83 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.46 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.77 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 497 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 436 aa  189  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 274 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 		 490 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>