271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1381 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 132 aa  258  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  73.68 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  64.12 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  63.36 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  63.36 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  63.36 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  63.36 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  62.6 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  62.6 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  62.6 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  62.6 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  61.07 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  61.07 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  61.83 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  61.83 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  61.07 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  61.07 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  61.83 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  61.07 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  63.43 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  57.58 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  57.25 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  56.06 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  59.09 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  56.06 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  70.37 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  61.36 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  56.39 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  63.36 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  61.83 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  61.48 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  53.49 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  49.26 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  60.61 
 
 		 136 aa  143  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  54.96 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  51.11 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50.37 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  47.76 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  49.63 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  48.15 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  45.59 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  45.99 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  45.26 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  58.33 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  60.94 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  48.15 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  53.03 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  53.1 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  53.1 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 199 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  49.63 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  48.15 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  51.49 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  51.77 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  48.15 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  51.52 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  53.03 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  62.14 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  54.68 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  48.15 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  48.95 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  52.27 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>