More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05575 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  100 
 
 		 333 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  71.39 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  67.67 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.66 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  62.05 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  60.42 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.36 
 
 		 359 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  60.36 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  58.93 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  55.08 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.5 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.07 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  51.22 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  52.85 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.4 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.45 
 
 		 434 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.72 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.07 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.53 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.29 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.53 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  45.03 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.28 
 
 		 408 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.18 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  46.34 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  43.07 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  43.07 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  43.07 
 
 		 408 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  46.86 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.7 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.61 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.34 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  44.28 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  45.78 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  45.4 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  45.02 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  43.03 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  44.18 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.15 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.13 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.34 
 
 		 350 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  43.33 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.43 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  45.9 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.37 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  47.45 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.81 
 
 		 438 aa  259  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  45.02 
 
 		 405 aa  259  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  47.2 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  45.02 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  41.79 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  48.83 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.36 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.15 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  47.72 
 
 		 369 aa  258  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.72 
 
 		 346 aa  258  8e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  45.78 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  45.18 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  44.79 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.97 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.5 
 
 		 435 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  45.9 
 
 		 433 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.43 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.75 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 349 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.18 
 
 		 428 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  42.99 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.95 
 
 		 423 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  46.59 
 
 		 434 aa  255  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.28 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  43.5 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  48.21 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.12 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  45.07 
 
 		 364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  42.38 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  45.57 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  45.57 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.25 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  43.65 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>