More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03050 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  100 
 
 
164 aa  323  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  62.03 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  48.77 
 
 
165 aa  163  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  46.95 
 
 
164 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  46.34 
 
 
164 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  54.27 
 
 
163 aa  152  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  43.9 
 
 
167 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  45.33 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  36.59 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 
175 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  38.12 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 
175 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  37.04 
 
 
175 aa  117  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  35.85 
 
 
175 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  36.71 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  36.25 
 
 
175 aa  101  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  34.59 
 
 
162 aa  99  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  39.74 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  35.44 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  42.31 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
178 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  36.88 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  34.62 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
206 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
194 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  37.21 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  36.49 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.72 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  34.36 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  34.4 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  33.77 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.48 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.17 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.51 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.83 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.19 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.48 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.23 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.08 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  27.4 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.48 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.75 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.38 
 
 
203 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30.77 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>