More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02860 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  44.08 
 
 
219 aa  191  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  45.64 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  40.28 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  41.14 
 
 
1523 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  38.22 
 
 
217 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  38.37 
 
 
211 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 
1340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  39.88 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  40 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 
1523 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  39.53 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  39.43 
 
 
229 aa  131  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  39.43 
 
 
229 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
1162 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
457 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  31.61 
 
 
231 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  38.95 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
681 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
581 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
996 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
785 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  34.15 
 
 
231 aa  95.5  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  37.58 
 
 
543 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  35.84 
 
 
222 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  32.58 
 
 
247 aa  88.6  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
1287 aa  88.2  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  29.94 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
229 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1314 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
1312 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  27.38 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  29.7 
 
 
353 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.54 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
353 aa  72  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.11 
 
 
353 aa  72  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
317 aa  72  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
746 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
1256 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  37 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.67 
 
 
305 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.09 
 
 
305 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.06 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.95 
 
 
310 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  27.63 
 
 
330 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
335 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.14 
 
 
303 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 
358 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
336 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.39 
 
 
318 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  22.84 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  25.91 
 
 
263 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
291 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
310 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.82 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.44 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  24.34 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  24.34 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  25.3 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  24.34 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  23.58 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  30.17 
 
 
342 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  26.12 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  28.15 
 
 
621 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  24.83 
 
 
318 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
710 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  26.02 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
382 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.49 
 
 
346 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  28.93 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
324 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 
298 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.66 
 
 
273 aa  55.1  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  24.22 
 
 
310 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  27.87 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  25.62 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  23.6 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>