More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2465 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  65.43 
 
 		 188 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  52.69 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  52.69 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  50.57 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  50 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  50.57 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  47.67 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  48.26 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  46.99 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  47.09 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  47.37 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  47.37 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  43.09 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.61 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  44.25 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  46.47 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  47.37 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  42.93 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  44.77 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  40.7 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.2 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  41.53 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  43.53 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  41.48 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.38 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.13 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.8 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.23 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  41.53 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.66 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.47 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  36.07 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  37.28 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.52 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.59 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  41.38 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  44.58 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  40.23 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.55 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  35.83 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  38.95 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.63 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.29 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  34.86 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  39.56 
 
 		 190 aa  94.4  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.78 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.15 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  34.94 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  38.76 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  42.77 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.78 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  36.84 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.48 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  37.36 
 
 		 397 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.6 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  35.45 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  37.7 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.71 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.43 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  37.43 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  38.64 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.71 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.12 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  36.11 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  36.11 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.12 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  36.84 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  36.11 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.53 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.56 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  34.95 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  34.57 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.56 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  35.56 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.56 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.91 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.56 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  39.88 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  37.02 
 
 		 406 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  33.33 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.9 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.42 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  38.95 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  34.12 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  36.36 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.84 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>