More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3028 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  80.44 
 
 		 413 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  81.66 
 
 		 420 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  100 
 
 		 436 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  81.91 
 
 		 413 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  84.05 
 
 		 405 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  81.91 
 
 		 413 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  76.31 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  69.8 
 
 		 419 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  69.8 
 
 		 419 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  60.05 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  60.36 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  57.39 
 
 		 415 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  53.66 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  54.15 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  49.88 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  49.4 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  49.48 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  49.48 
 
 		 411 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  47.56 
 
 		 411 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  50.63 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  49.03 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  45.83 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  49.76 
 
 		 461 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  48.18 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  41.77 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  46.04 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  43.8 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  45.5 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.69 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  44.31 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  43.44 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.64 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  43.56 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  38.89 
 
 		 412 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  38.41 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  46.35 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  38.65 
 
 		 486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  39.95 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.97 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.34 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  36.05 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  39.3 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  38.06 
 
 		 420 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  38.2 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.96 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  35.61 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  36.87 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.33 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  35.31 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.76 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.66 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.12 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.64 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  36.52 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  35.15 
 
 		 426 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  34.78 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.36 
 
 		 429 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.85 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.23 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.65 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  33.09 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.39 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.29 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.19 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.61 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.01 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.19 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.18 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.13 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.33 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.43 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.48 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  33.42 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.03 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  33.65 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.02 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  32.43 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.56 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.48 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.69 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.49 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.49 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.49 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  35 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  33.42 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.64 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.3 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.25 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.95 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  37.04 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.98 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.85 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.87 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.87 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.87 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.65 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  34.42 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.41 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.17 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.93 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>