More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2674 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  65.12 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  64.77 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  63.87 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  61.68 
 
 		 280 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.5 
 
 		 284 aa  321  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 		 282 aa  321  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  59.27 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  56.32 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.31 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.76 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.95 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.24 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.51 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  50.92 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  49.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  47.23 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  48.5 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  45.49 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  47.46 
 
 		 284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  46.47 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.01 
 
 		 285 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 280 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 293 aa  214  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 		 273 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 286 aa  201  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>