More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1383 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1383  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
313 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.535175  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2001  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.11761  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.8 
 
 
307 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5577  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
309 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1161  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.76 
 
 
319 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0329373  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4319  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.78 
 
 
307 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328241  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 
307 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0279925  normal  0.357497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0935  amino acid ABC transporter permease  42.24 
 
 
331 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.38791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2362  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
305 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3682  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.66 
 
 
303 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.537198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1067  ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
333 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5407  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
352 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1988  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
316 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 
318 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0389  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.26 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4596  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.33 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
365 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.66 
 
 
310 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.797636  normal  0.0345296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1317  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.25 
 
 
299 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2853  amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
292 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  37.34 
 
 
369 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 
602 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2933  amino acid ABC transporter, permease protein  39 
 
 
332 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.849653  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
308 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3517  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.84 
 
 
292 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.851369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27180  amino acid ABC transporter membrane protein  39.24 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.69 
 
 
597 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0100  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
318 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
595 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  36.86 
 
 
597 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 
597 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.82 
 
 
619 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
595 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3798  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
349 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  38.65 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
297 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
592 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
290 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0200727 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
297 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  36.84 
 
 
329 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
324 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 
291 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
333 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2097  ABC transporter permease  35.56 
 
 
285 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0928  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
329 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0258353  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.61 
 
 
306 aa  175  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3033  amino acid ABC transporter permease  40.22 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.253474  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.380934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
598 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3767  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 
352 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33193  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
307 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3687  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.73 
 
 
310 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822244  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7608  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  34.94 
 
 
290 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.08 
 
 
581 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
283 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 
306 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 
276 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.9196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
594 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 
321 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.48 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 
295 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 
314 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.25 
 
 
636 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.25 
 
 
636 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.25 
 
 
636 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.25 
 
 
636 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.25 
 
 
636 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.25 
 
 
636 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.25 
 
 
636 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
290 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0405  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 
311 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
513 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0724  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
241 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  35.43 
 
 
263 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  35.62 
 
 
217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  36.24 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0712  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1071  hypothetical protein  38.28 
 
 
235 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  33.49 
 
 
319 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.27 
 
 
503 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  31.53 
 
 
727 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.55 
 
 
492 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
223 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 
489 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
320 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  33.76 
 
 
489 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  32.58 
 
 
242 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
226 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 
489 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
217 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>