97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4424 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  74.47 
 
 		 99 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  51 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  50.52 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  56.79 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  45.19 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  49 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  49.4 
 
 		 99 aa  87  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  50.52 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  54.43 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  52.53 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  52.58 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  46.94 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  50.55 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  43.88 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  52.56 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45.36 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  45.36 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  46.94 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  46.94 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  43.33 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  41.24 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  48.05 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 960 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  45.59 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  42.35 
 
 		 469 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  38.54 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  45.57 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  51.43 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  60 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  42.67 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.83 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 983 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  33.71 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.71 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  33.71 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  40.23 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  34.83 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.42 
 
 		 591 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.77 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  36.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  34.34 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 984 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  37.65 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  32.58 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  33.71 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  36.47 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  37.65 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.58 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.99 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  30.67 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  34.62 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  34.67 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.67 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.86 
 
 		 452 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  34.21 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  34.67 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  33.78 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  35.37 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.15 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  31.17 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  47.73 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.62 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  34.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.62 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  28.95 
 
 		 102 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  30.34 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  32.93 
 
 		 609 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  45.45 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  43.18 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  26.6 
 
 		 968 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  33.75 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>