46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2489 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  55.41 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  55.81 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  55.15 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  55.15 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  52.81 
 
 		 420 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  55.15 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  56.1 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  56.1 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  56.36 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  56.36 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  29.38 
 
 		 468 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  23.81 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.55 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  34.78 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  31.2 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>