More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6739 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
443 aa  893    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  95.94 
 
 
443 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  71.86 
 
 
443 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  69.43 
 
 
447 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  72.9 
 
 
444 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  74.13 
 
 
439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  70.69 
 
 
447 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  72.29 
 
 
447 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  71.84 
 
 
446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  70 
 
 
417 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  59.29 
 
 
436 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  59.32 
 
 
441 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  54.48 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  54.48 
 
 
436 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  54.83 
 
 
436 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  57.11 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  56.35 
 
 
441 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  57.14 
 
 
439 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 
436 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  55.99 
 
 
437 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 
437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  57.14 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  57.04 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  56.69 
 
 
428 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  54.38 
 
 
438 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  55.48 
 
 
441 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  51.53 
 
 
429 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  56.47 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  51.56 
 
 
437 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 
430 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  53 
 
 
437 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 
437 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 
419 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  56.79 
 
 
441 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  56.05 
 
 
441 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  56.05 
 
 
441 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  49.63 
 
 
431 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  55.83 
 
 
428 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  47.39 
 
 
433 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
432 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  46.9 
 
 
432 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  54.96 
 
 
428 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  46.51 
 
 
429 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
432 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  46.51 
 
 
429 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  44.44 
 
 
438 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
450 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
429 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  39.2 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  39.81 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  36.57 
 
 
431 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  38.63 
 
 
421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  36.28 
 
 
438 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.95 
 
 
430 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  28.26 
 
 
436 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.4 
 
 
411 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
408 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
416 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  33.33 
 
 
412 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
425 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  32.31 
 
 
413 aa  143  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.62 
 
 
418 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
416 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.99 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.69 
 
 
391 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.3 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
398 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
398 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
415 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.17 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.13 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.04 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  25.06 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.3 
 
 
402 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.02 
 
 
380 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.91 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
411 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.52 
 
 
402 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.52 
 
 
402 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.27 
 
 
419 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.91 
 
 
402 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
407 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
405 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.01 
 
 
402 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.97 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.97 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.17 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.81 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.71 
 
 
400 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.73 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.22 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.57 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.57 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.57 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>