More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5591 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  82.68 
 
 
232 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  83.12 
 
 
232 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  81.9 
 
 
232 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  82.68 
 
 
234 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  83.12 
 
 
234 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  83.12 
 
 
234 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  82.68 
 
 
234 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  81.82 
 
 
232 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  78.45 
 
 
232 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  70.26 
 
 
234 aa  349  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  73.09 
 
 
231 aa  343  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  71.98 
 
 
232 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  71.98 
 
 
232 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  71.12 
 
 
232 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  69.27 
 
 
230 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  69.27 
 
 
230 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  57.85 
 
 
235 aa  271  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  54.66 
 
 
242 aa  261  8e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.18 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  45.79 
 
 
240 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
235 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  43.24 
 
 
240 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.41 
 
 
246 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.93 
 
 
315 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  43.24 
 
 
241 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
240 aa  187  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  45.29 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  44.93 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  42.48 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  38.94 
 
 
293 aa  181  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  42.6 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  42.34 
 
 
255 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.1 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
259 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  45.29 
 
 
231 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.75 
 
 
246 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.84 
 
 
231 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43 
 
 
225 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43 
 
 
225 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  40.91 
 
 
254 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  43.54 
 
 
251 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.24 
 
 
228 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
235 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  40.91 
 
 
249 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  42.27 
 
 
252 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.86 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  42.13 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  39.73 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  45.41 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  45 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  44.2 
 
 
246 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
222 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  42.6 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
235 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
247 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  39.47 
 
 
236 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  40.36 
 
 
258 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  39.38 
 
 
240 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.59 
 
 
227 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
256 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  40.85 
 
 
221 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  41.55 
 
 
228 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.53 
 
 
230 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
277 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  44.19 
 
 
230 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
214 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  36.94 
 
 
241 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.26 
 
 
233 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
262 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
230 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 
233 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.01 
 
 
237 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.26 
 
 
233 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.01 
 
 
237 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  40.45 
 
 
228 aa  168  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.91 
 
 
223 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.59 
 
 
235 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.36 
 
 
237 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.44 
 
 
236 aa  167  9e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.26 
 
 
235 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  41.81 
 
 
230 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
233 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>