51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0145 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  84.87 
 
 		 119 aa  208  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 109 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  66.34 
 
 		 109 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  49 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  45.19 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  45.71 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  45.71 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  43 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  43.84 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  40.4 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  50.72 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  45.71 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  40.7 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  43.21 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  39.51 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  36.99 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  38.75 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  38.75 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  38.75 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 68 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>