290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5880 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  100 
 
 		 446 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  58.37 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  41.27 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  39.72 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  39.72 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  40.82 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  39.68 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  36.47 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  33.02 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  29.62 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  30.61 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  29.91 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  29.91 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  28.95 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28.54 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  28.44 
 
 		 441 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  28.64 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  27.96 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  28.64 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  28.64 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  28.89 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.83 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  28.76 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  28.76 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  31.87 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  28.63 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  28.86 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  30.04 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  29.18 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  31.06 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  28.19 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.73 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  29.18 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  28.79 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  31.31 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  29.93 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  30.27 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  31.73 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  29.42 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  28.19 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  28.95 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  28.95 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  28.95 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  28.95 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  28.51 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.82 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  31.47 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.73 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  28.97 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  31.98 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.91 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.52 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.28 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  28.34 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.4 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.13 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  28.7 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.25 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  30.35 
 
 		 967 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.18 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  27.27 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.94 
 
 		 577 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  28.34 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.85 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.06 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.23 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.23 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  26.82 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27.91 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.92 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.17 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.07 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.24 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  24.43 
 
 		 429 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  26.47 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.9 
 
 		 401 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.82 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  26.57 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.6 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  24.08 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  25.12 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.68 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  26.1 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  27.91 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  26.16 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  28.31 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  30.33 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  20.71 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  20.71 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  23.82 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.25 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  27.33 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.16 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  27.61 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.12 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  22.47 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  27.91 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  27.46 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  27.46 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  28.54 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>