146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4078 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.49 
 
 		 194 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  76.44 
 
 		 195 aa  316  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.04 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.04 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  50.51 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  50.26 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.08 
 
 		 215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  47.52 
 
 		 202 aa  187  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  46.6 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  42.63 
 
 		 194 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  45.11 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  43.81 
 
 		 194 aa  167  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  45.56 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.86 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.58 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  42.49 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  42.49 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  45.5 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  41.97 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  44.5 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  40.98 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  40.78 
 
 		 189 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  40.78 
 
 		 189 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  40.78 
 
 		 189 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.96 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  42.25 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  40.22 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  39.66 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.21 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.22 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.58 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  39.58 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  39.58 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  40.22 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.69 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.17 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  27.72 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.11 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.26 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  29.89 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.14 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.26 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.57 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.97 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.37 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 118 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  29.35 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.38 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  25.7 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.54 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.62 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.7 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.46 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.57 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.48 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  22.6 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.48 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.59 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  25.37 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.99 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  30.7 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  26.17 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  25.47 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  23.6 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  27.13 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  24.14 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  25.67 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  22.87 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  22.87 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.43 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.19 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.62 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>