More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0987 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  75.78 
 
 
242 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  74.21 
 
 
242 aa  307  1e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  68.67 
 
 
233 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  69.13 
 
 
233 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  70.54 
 
 
233 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  67.38 
 
 
233 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  69.13 
 
 
233 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
276 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
264 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
231 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
231 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
231 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
231 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  71.23 
 
 
231 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  70.32 
 
 
276 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  69.13 
 
 
233 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  68.7 
 
 
266 aa  285  3e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  58.64 
 
 
230 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  59.09 
 
 
224 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  58.64 
 
 
224 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  44.39 
 
 
221 aa  153  3e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 
192 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  34.11 
 
 
244 aa  119  4e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 
218 aa  119  5e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
220 aa  117  2e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  32.09 
 
 
220 aa  114  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  32.09 
 
 
220 aa  114  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  34.85 
 
 
213 aa  112  4e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  41.14 
 
 
226 aa  112  4e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.84 
 
 
212 aa  109  4e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01651e-08  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.19 
 
 
240 aa  109  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  36.78 
 
 
213 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 
225 aa  108  8e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  33.48 
 
 
256 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.79 
 
 
258 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  28.84 
 
 
243 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  37.26 
 
 
244 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  35.58 
 
 
241 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  36.92 
 
 
202 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
215 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
255 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  37.11 
 
 
277 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  34.7 
 
 
362 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 
247 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.18071e-06  hitchhiker  8.7208e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.55 
 
 
225 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  34.58 
 
 
225 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  36.67 
 
 
244 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
262 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 
225 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  34.02 
 
 
241 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  34.02 
 
 
241 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  34.02 
 
 
241 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
262 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  35.9 
 
 
262 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 
225 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 
225 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.55 
 
 
225 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.55 
 
 
225 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  32.67 
 
 
352 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.55 
 
 
225 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.39 
 
 
240 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.10517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 
225 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 
225 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.55 
 
 
225 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  34.55 
 
 
225 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
241 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  33.5 
 
 
227 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.08 
 
 
225 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.46354e-05 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 
242 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
222 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.08 
 
 
225 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
225 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
255 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  31.98 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  32.43 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  31.86 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  30.35 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  34.2 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  29.13 
 
 
246 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
240 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  31.79 
 
 
231 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.55 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.19 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  29.72 
 
 
246 aa  99  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.65903e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  31.28 
 
 
226 aa  99  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  2.19285e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  38.12 
 
 
212 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  31.98 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  28.29 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.78919e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  31.98 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.22 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  30.35 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  30.35 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.48641e-06 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  33.94 
 
 
363 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>