More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0273 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
136 aa  270  7e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
141 aa  83.2  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
140 aa  80.9  6e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.8 
 
 
141 aa  80.1  1e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 
133 aa  79  2e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
137 aa  78.6  3e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  32.37 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
132 aa  76.3  1e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
134 aa  76.6  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.33 
 
 
134 aa  76.6  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.04 
 
 
142 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  33.33 
 
 
133 aa  74.3  5e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
136 aa  73.6  9e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.71 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  36.15 
 
 
136 aa  72.8  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
139 aa  72.8  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.1299e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  32.8 
 
 
132 aa  71.6  3e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 
135 aa  71.6  3e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  29.2 
 
 
143 aa  71.6  3e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
136 aa  71.2  5e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  33.33 
 
 
138 aa  70.9  5e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  33.59 
 
 
153 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
135 aa  70.5  8e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
134 aa  69.7  1e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  33.59 
 
 
153 aa  69.3  1e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  33.09 
 
 
136 aa  69.7  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  33.59 
 
 
153 aa  69.3  1e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.37 
 
 
143 aa  69.3  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
138 aa  69.3  2e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  33.33 
 
 
135 aa  68.6  3e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
148 aa  68.6  3e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.16 
 
 
139 aa  68.6  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 
140 aa  68.2  4e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.45 
 
 
137 aa  67.8  5e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.74 
 
 
142 aa  67.8  5e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.65 
 
 
140 aa  67.4  6e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  32.81 
 
 
135 aa  67.4  6e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.3 
 
 
135 aa  67  8e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 
141 aa  67  8e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
145 aa  67  8e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  31.01 
 
 
145 aa  67  8e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  29.37 
 
 
139 aa  67  9e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
133 aa  66.6  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 
141 aa  66.2  1e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.17 
 
 
143 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.11 
 
 
134 aa  66.2  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.66 
 
 
134 aa  65.9  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  33.9 
 
 
141 aa  65.9  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  37.7 
 
 
133 aa  65.9  2e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.66 
 
 
134 aa  65.1  3e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
138 aa  65.1  3e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  4.63213e-07 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
158 aa  64.7  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  2.37185e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  1.06541e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  2.46582e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
136 aa  65.1  4e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.25 
 
 
136 aa  64.7  4e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.01 
 
 
142 aa  64.7  4e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  29.93 
 
 
134 aa  64.7  4e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  33.07 
 
 
143 aa  64.3  5e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
154 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  30.22 
 
 
142 aa  64.3  5e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
142 aa  64.3  5e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  64.3  6e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.66 
 
 
141 aa  64.3  6e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 
159 aa  64.3  6e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  64.3  6e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  27.74 
 
 
147 aa  64.3  6e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  29.75 
 
 
154 aa  63.9  8e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
134 aa  63.9  8e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
134 aa  63.5  8e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  6.99577e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  63.5  9e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  1.53595e-05 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
135 aa  63.5  1e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.78 
 
 
144 aa  62.8  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.76409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.6 
 
 
134 aa  62.8  1e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  28.78 
 
 
144 aa  62.8  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.62541e-07  hitchhiker  2.51452e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  28.78 
 
 
144 aa  62.8  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.88711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
134 aa  63.5  1e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  32.37 
 
 
134 aa  63.2  1e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
140 aa  63.2  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
132 aa  62.4  2e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.71 
 
 
134 aa  62  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.4 
 
 
176 aa  62.4  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  31.4 
 
 
173 aa  62.4  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.4 
 
 
176 aa  62.4  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.4 
 
 
176 aa  62.4  2e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
143 aa  62.4  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13024e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.2 
 
 
134 aa  62.4  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.71 
 
 
134 aa  62.8  2e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.01 
 
 
146 aa  62.4  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32.31 
 
 
132 aa  62.4  2e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.4 
 
 
176 aa  62.4  2e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
135 aa  62.4  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
144 aa  62  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
134 aa  61.6  3e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  28.99 
 
 
134 aa  62  3e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
155 aa  62  3e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.81 
 
 
144 aa  61.6  3e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>