More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1227 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  613  1e-174  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  98.01 
 
 
301 aa  604  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  97.67 
 
 
301 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  97.67 
 
 
301 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  97.34 
 
 
301 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  96.35 
 
 
307 aa  593  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  97.01 
 
 
301 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
327 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
300 aa  573  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
300 aa  573  1e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
300 aa  573  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
300 aa  573  1e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
300 aa  573  1e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
327 aa  573  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 
327 aa  573  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  89.33 
 
 
300 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  89 
 
 
300 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  87.29 
 
 
300 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  79.6 
 
 
309 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  78.93 
 
 
309 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1300  transcriptional regulator, LysR family  78.93 
 
 
309 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0123787  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  79.46 
 
 
362 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  77 
 
 
304 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 
304 aa  452  1e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  69.23 
 
 
307 aa  440  1e-122  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  66.67 
 
 
312 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
324 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  66.34 
 
 
312 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  68.77 
 
 
300 aa  424  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 
310 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3697  LysR family transcriptional regulator  63.95 
 
 
321 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 
325 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0457  transcriptional regulator, LysR family  63.34 
 
 
314 aa  405  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
331 aa  327  2e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  48.49 
 
 
303 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  48.16 
 
 
303 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2258  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
303 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2174  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
303 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2298  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
303 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2423  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
303 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3286  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 
303 aa  321  9e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  48.16 
 
 
303 aa  321  1e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1619  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 
303 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.542444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1397  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
303 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1814  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
303 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.841651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1786  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  49.5 
 
 
302 aa  315  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2459  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 
304 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1783  transcriptional regulator, LysR family  50.67 
 
 
304 aa  314  1e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.294417 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6202  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
321 aa  313  2e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1900  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  313  2e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.69534e-07 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1877  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
321 aa  313  2e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5177  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  312  5e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1300  transcriptional regulator, LysR family  47.51 
 
 
301 aa  306  2e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2313  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 
301 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
306 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
305 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
309 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.53 
 
 
306 aa  241  8e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.67 
 
 
298 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
314 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
305 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 
307 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 
307 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
303 aa  232  7e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 
308 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
306 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 
298 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
304 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
307 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
311 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
313 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.67 
 
 
304 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
304 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.02 
 
 
293 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
298 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
313 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 
304 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
303 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
308 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
335 aa  222  5e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
301 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
301 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
301 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
301 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
289 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
333 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
296 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
313 aa  221  1e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1958  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 
307 aa  221  1e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 
300 aa  221  1e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 
310 aa  220  2e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 
305 aa  221  2e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
304 aa  221  2e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
308 aa  220  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
313 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
297 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
313 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
302 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 
311 aa  218  8e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>