216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4186 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 
368 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  95.65 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  92.93 
 
 
368 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  67.66 
 
 
370 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  62.7 
 
 
369 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  55.5 
 
 
372 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  55.53 
 
 
375 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  53.85 
 
 
401 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  51.47 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  52.43 
 
 
366 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  52.43 
 
 
366 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  45.45 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  40.99 
 
 
385 aa  291  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  35.16 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  33.33 
 
 
710 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.44 
 
 
363 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  32.89 
 
 
363 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  30.87 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  31.34 
 
 
357 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  29.79 
 
 
367 aa  172  9e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.99 
 
 
379 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  31.44 
 
 
604 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  29.74 
 
 
365 aa  155  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  27.69 
 
 
376 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  28.24 
 
 
401 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.34 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.91 
 
 
391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  26.17 
 
 
281 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  32.84 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  32.84 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  33.11 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  24.21 
 
 
544 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  27.52 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  34.62 
 
 
260 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  27.96 
 
 
435 aa  53.5  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  31.94 
 
 
472 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  27.59 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  23.1 
 
 
597 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  28.02 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  26.06 
 
 
281 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  33.33 
 
 
463 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  28.48 
 
 
315 aa  50.8  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  33.1 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  35.77 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  26.78 
 
 
287 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  27.92 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  29.19 
 
 
447 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  27.92 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.67 
 
 
293 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  27.92 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  27.92 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  29.19 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
296 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.85 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  23.98 
 
 
288 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  37 
 
 
441 aa  49.7  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.15 
 
 
480 aa  49.7  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  26.17 
 
 
290 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  32.77 
 
 
473 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  27.52 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  27.98 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  38.37 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  30.07 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  28.65 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  23.64 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  28 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  25.5 
 
 
290 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  31.82 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  28.19 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  33.55 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  26.49 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  27.63 
 
 
444 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  34.53 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 
669 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  27.85 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  33.09 
 
 
441 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  34.21 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 
455 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.15 
 
 
464 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  35.8 
 
 
455 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  28.5 
 
 
445 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 
465 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 
465 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  28.99 
 
 
494 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>