More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2370 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 
518 aa  1023    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  62.93 
 
 
509 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  62.93 
 
 
504 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  49.81 
 
 
585 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  49.4 
 
 
519 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  48.86 
 
 
544 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.45 
 
 
544 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
505 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.14 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  44.62 
 
 
497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  42.32 
 
 
500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  42.32 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  42.69 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  42.32 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
523 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.24 
 
 
525 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.91 
 
 
508 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  41.7 
 
 
499 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  46.59 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 
508 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.87 
 
 
512 aa  399  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.2 
 
 
517 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 
525 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.72 
 
 
497 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  43.71 
 
 
501 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  42.6 
 
 
501 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
497 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43.33 
 
 
500 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
500 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  40.66 
 
 
499 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  43.33 
 
 
500 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.91 
 
 
511 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 
498 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.35 
 
 
514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.48 
 
 
516 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
500 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44 
 
 
517 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
507 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  43.33 
 
 
500 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.35 
 
 
514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.57 
 
 
515 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
500 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
510 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
504 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  43.21 
 
 
500 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.79 
 
 
520 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
500 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  43 
 
 
513 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.92 
 
 
496 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.35 
 
 
514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  39.44 
 
 
497 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.51 
 
 
514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.09 
 
 
517 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  42.26 
 
 
517 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.09 
 
 
517 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.26 
 
 
517 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.75 
 
 
508 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
499 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  44.33 
 
 
504 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  43.45 
 
 
512 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 
525 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.4 
 
 
511 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.48 
 
 
495 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.49 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.53 
 
 
513 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  45.38 
 
 
504 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
510 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.03 
 
 
513 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  45.18 
 
 
504 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.65 
 
 
514 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.84 
 
 
513 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.49 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  45.38 
 
 
504 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.69 
 
 
517 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.09 
 
 
506 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.85 
 
 
507 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 
517 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
522 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
512 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  43.91 
 
 
496 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  42.14 
 
 
504 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
507 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.97 
 
 
507 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.94 
 
 
524 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.66 
 
 
499 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  41.56 
 
 
513 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 
515 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.7 
 
 
499 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.57 
 
 
503 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.72 
 
 
507 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.18 
 
 
506 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  44.86 
 
 
505 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>