More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2318 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  100 
 
 
394 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  80.1 
 
 
394 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  51.79 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  36.83 
 
 
392 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.25 
 
 
394 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.34 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.65 
 
 
433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.16 
 
 
412 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  34.34 
 
 
401 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.01 
 
 
393 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  32.93 
 
 
421 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.89 
 
 
393 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.57 
 
 
443 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.74 
 
 
394 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.68 
 
 
414 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  33.76 
 
 
407 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.76 
 
 
411 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
406 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.58 
 
 
414 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.63 
 
 
896 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.03 
 
 
885 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.25 
 
 
435 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.37 
 
 
406 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  33.08 
 
 
406 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.76 
 
 
420 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.5 
 
 
406 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.14 
 
 
435 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  34.26 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.92 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  30.98 
 
 
420 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.94 
 
 
604 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.2 
 
 
429 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.94 
 
 
604 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.62 
 
 
417 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.5 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  31.79 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.17 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.85 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.2 
 
 
406 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.91 
 
 
444 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  31.16 
 
 
416 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.9 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.35 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.43 
 
 
428 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.25 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.25 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.66 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.41 
 
 
412 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.22 
 
 
419 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  33.84 
 
 
434 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.95 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  30.2 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  30.2 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  29.95 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  30.2 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 
417 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  29.95 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  29.95 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.92 
 
 
417 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.69 
 
 
413 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.34 
 
 
414 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  34.12 
 
 
496 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  29.95 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.74 
 
 
426 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  36.63 
 
 
381 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 
406 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.52 
 
 
610 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.42 
 
 
644 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.14 
 
 
432 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.01 
 
 
414 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 
414 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.59 
 
 
414 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.6 
 
 
434 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.42 
 
 
419 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  30.2 
 
 
406 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.34 
 
 
413 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.42 
 
 
419 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.19 
 
 
414 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.74 
 
 
449 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.12 
 
 
412 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.48 
 
 
413 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.22 
 
 
880 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  29.06 
 
 
413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.77 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.33 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.98 
 
 
879 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 
442 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 
413 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  30.42 
 
 
665 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.08 
 
 
414 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  34.38 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  31.97 
 
 
424 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  31.68 
 
 
413 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.54 
 
 
641 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.89 
 
 
413 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  31.94 
 
 
414 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.58 
 
 
406 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.58 
 
 
406 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  31.34 
 
 
414 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>