96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5828 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  91.34 
 
 
387 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  99.22 
 
 
385 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  99.22 
 
 
385 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  95.84 
 
 
385 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  90.62 
 
 
387 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  76.36 
 
 
388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  77.31 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  77.89 
 
 
382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  68.67 
 
 
386 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  69.92 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  43.94 
 
 
407 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  43.16 
 
 
407 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  42.65 
 
 
405 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  45.09 
 
 
409 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  41.41 
 
 
382 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  37.2 
 
 
387 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  38.67 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  38.35 
 
 
394 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  37.83 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
408 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  37.97 
 
 
403 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  34.27 
 
 
413 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  40.11 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  34.24 
 
 
403 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  33.94 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  29.19 
 
 
422 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  32.41 
 
 
404 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  34.32 
 
 
432 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  32.72 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  30.93 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  32.2 
 
 
403 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  27.65 
 
 
422 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  31.02 
 
 
412 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  33 
 
 
400 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  29.14 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  28.42 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  28.74 
 
 
445 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  27.7 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  33.7 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  30.26 
 
 
401 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  31.96 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  32.25 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  29.15 
 
 
430 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  28.35 
 
 
439 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  31.65 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  31.33 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  25.5 
 
 
388 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  31.01 
 
 
406 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
406 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  31.92 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
421 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
421 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
421 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 
414 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  30.28 
 
 
414 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.07 
 
 
420 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  26.84 
 
 
439 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  27.49 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  25.24 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  29.94 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  25.77 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  24.56 
 
 
399 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  27.96 
 
 
513 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  33.06 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  24.16 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  28.31 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  26.71 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  24.61 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  29.59 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  25.28 
 
 
509 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  34.19 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  26.89 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  34.01 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  26.05 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  41.18 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  29.23 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  24.55 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  30.28 
 
 
445 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  28.33 
 
 
565 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  35.48 
 
 
441 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  40.71 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  31.08 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  23.41 
 
 
448 aa  52.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  37.37 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  27.14 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1889  protein of unknown function DUF1501  27.18 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  27.4 
 
 
483 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2793  protein of unknown function DUF1501  31.36 
 
 
481 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  33.87 
 
 
466 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>