More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1542 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  99.71 
 
 		 345 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  97.97 
 
 		 345 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  95.94 
 
 		 345 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  95.94 
 
 		 345 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  95.07 
 
 		 345 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  90.31 
 
 		 344 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  90.31 
 
 		 344 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  90 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  87.06 
 
 		 339 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  71.98 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  66.09 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  66.86 
 
 		 346 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2862  monosaccharide-transporting ATPase  69.3 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0408781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  67.71 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  57.94 
 
 		 331 aa  361  8e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  55.92 
 
 		 341 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  58.01 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  58.01 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  58.01 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  58.99 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  57.41 
 
 		 332 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  46.06 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  46.06 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  46.11 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  49.5 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  48.43 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  48.08 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 313 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  47.74 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  47.74 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  45.19 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.72 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.72 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  43.67 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  48.18 
 
 		 835 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  45.02 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.11 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  46.37 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.81 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.7 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.7 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  43.92 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 342 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 342 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 342 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.76 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  44.34 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.79 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  45.06 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.67 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  41.97 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  41.97 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  41.97 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.03 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  45.36 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  41.74 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.33 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  41.56 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 		 365 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  41.09 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.02 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  41.97 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  43.56 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  45.27 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  38.75 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>