More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3289 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.04 
 
 
585 aa  846  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
582 aa  1149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  71.18 
 
 
582 aa  790  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  73.58 
 
 
603 aa  823  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  72.63 
 
 
582 aa  805  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  55.19 
 
 
574 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 
568 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  55.54 
 
 
574 aa  573  1e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.09 
 
 
554 aa  572  1e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 
583 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.34 
 
 
591 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  54.15 
 
 
579 aa  561  1e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  55.27 
 
 
573 aa  563  1e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.2 
 
 
605 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  52.93 
 
 
577 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 
600 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 
573 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.43 
 
 
583 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  55.22 
 
 
578 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  54.77 
 
 
552 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 
584 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  51.13 
 
 
572 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  54.14 
 
 
579 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  53.79 
 
 
579 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  53.51 
 
 
569 aa  527  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  54.4 
 
 
595 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.12 
 
 
587 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.7 
 
 
567 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  55.39 
 
 
579 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  52.21 
 
 
582 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  52.82 
 
 
593 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  53.82 
 
 
575 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  54.84 
 
 
579 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  54.84 
 
 
579 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 
576 aa  505  1e-142  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  55.01 
 
 
581 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  54.97 
 
 
585 aa  492  1e-138  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 
603 aa  492  1e-138  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  52.26 
 
 
585 aa  493  1e-138  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
639 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 
582 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  47.99 
 
 
567 aa  448  1e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
562 aa  400  1e-110  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 
581 aa  399  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 
583 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
546 aa  321  2e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.1 
 
 
545 aa  304  3e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 
525 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
542 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
516 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
539 aa  285  1e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
524 aa  283  7e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
529 aa  280  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
543 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
531 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
537 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
530 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 
537 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.81 
 
 
525 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.51 
 
 
700 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
534 aa  271  3e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
532 aa  270  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 
532 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
532 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
567 aa  267  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.29 
 
 
559 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
559 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
566 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
557 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
536 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
519 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
528 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
560 aa  261  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
519 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
559 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
519 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
543 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
527 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
556 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
518 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
546 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
559 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
548 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
533 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.7 
 
 
522 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
547 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  35.51 
 
 
602 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
576 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
540 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
554 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
543 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 
529 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  36.14 
 
 
517 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
552 aa  234  2e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
557 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
508 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  34.35 
 
 
668 aa  230  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.37 
 
 
520 aa  229  8e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.09 
 
 
798 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
564 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>