31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0877 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  100 
 
 		 366 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  51.32 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0922  hypothetical protein  58.25 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000636245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  35.74 
 
 		 237 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1509 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1291 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  34.15 
 
 		 1488 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  32.77 
 
 		 233 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  32.06 
 
 		 2144 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  32.65 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  28.52 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  29.22 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0929  hypothetical protein  34.86 
 
 		 307 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000192254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  24.41 
 
 		 594 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  34.01 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  26.64 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  24.8 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  41.18 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  31.82 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  25.41 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2607  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00391895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  25.3 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  25.34 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  23.4 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  29.1 
 
 		 539 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  24.59 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  26.85 
 
 		 466 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1343 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>