23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3198 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  40.1 
 
 		 1465 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  33.85 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  34.65 
 
 		 1509 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  34.51 
 
 		 1488 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  33.83 
 
 		 412 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  33.68 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  32.65 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  32.82 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  32.82 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  32.5 
 
 		 2144 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  31.98 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  25.24 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  27.18 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  30.33 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  23.3 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  31.88 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  23.18 
 
 		 557 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  22.78 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  26.43 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  21.74 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  22.86 
 
 		 597 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>