20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2682 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.81 
 
 		 1509 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  31.82 
 
 		 1488 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  26.48 
 
 		 594 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  28.46 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  27.87 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  30.88 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1465 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  27.75 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.43 
 
 		 2144 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1291 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  31.09 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  27.18 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  34.58 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  27.5 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  26.42 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  23.38 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  34.15 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  25.91 
 
 		 466 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  25.18 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>