23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0537 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1130    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1465 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1291 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  28.77 
 
 		 298 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.73 
 
 		 2144 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.09 
 
 		 1509 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  29.61 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.55 
 
 		 1488 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  27.92 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  24.53 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  31.49 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  23.53 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  29.01 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  31.87 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  29.21 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  23.56 
 
 		 233 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  33.96 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  20.89 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  25.11 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  22.46 
 
 		 382 aa  44.3  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>