27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6275 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  32.09 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  31.89 
 
 		 287 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.96 
 
 		 1509 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.91 
 
 		 1488 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  29.61 
 
 		 594 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1291 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  29.1 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  27.46 
 
 		 238 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  26.1 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1465 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  27.73 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  28.44 
 
 		 2144 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  27.95 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  23.94 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  39.36 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  28.88 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  23.3 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  24.26 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  26.42 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  26.41 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  23.94 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  22.92 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  26 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  23.28 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  25.41 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>