24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  42.55 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  41.77 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  38.72 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1465 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  34.91 
 
 		 1509 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  35.94 
 
 		 1488 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  32.77 
 
 		 366 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  33.68 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  31.67 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  35.4 
 
 		 2144 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  37.93 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  27.75 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  23 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  35.77 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  34.75 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  28.88 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  29.93 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  24.2 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  24.6 
 
 		 539 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  24.26 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  18.95 
 
 		 374 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>